藿香正氣水作為經典藥物，在很多領域都有較好的應用，但用其去除腳氣并不科學，可能因藿香正氣水含有酒精的緣故，所以認為其可能有一定的去除腳氣的作用，但實際上酒精無法殺滅真菌，所以并不是一個好方法。 腳氣有較好的抗真菌藥物，如達克寧、鹽酸特比萘芬乳膏、硝酸鎂、氟康唑軟膏、酮康唑軟膏、環吡酮胺軟膏，均為治療真菌感染有效的藥膏，故治療腳氣可選擇便宜且效果佳的抗真菌藥膏。但腳氣易復發，一個原因是足部微環境潮濕溫暖，易滋生真菌感染。 另一個重要原因是抗真菌感染的藥膏，建議延長治療時間，通常1-2周后腳氣即好，不癢且不脫皮，若此時停止用藥，實際上真菌還未被殺死，其生長周期很長，則較易復發，所以通常推薦外用抗真菌藥膏的治療方法，持續使用3個月徹底去除腳氣。