肺結核的咳嗽和普通咳嗽沒有明顯區別，但是臨床鑒別可以做到。因為肺結核患者多半是結核桿菌導致的感染，多半都是干咳、少量黏痰，而日常生活中其他病毒感染，如支原體、衣原體感染，可能也是干咳、少量黏痰。因此肺結核感染的咳嗽和衣原體、支原體、卡他莫拉菌、流感、嗜血桿菌、軍團菌，還有病毒導致的咳嗽都沒有明顯的區別，則給臨床診斷肺結核帶來了一些困難。但大多數肺結核患者咳嗽的同時，肺上一定有病灶，如果沒有病灶，就不可能考慮是肺結核，而普通急慢性支氣管炎導致的干咳和少量黏液痰，大多數肺上沒有病灶，如果有病灶就要考慮是肺炎。