通常會厭囊腫造成的感覺是咽部異物感，覺得嗓子里面總有東西不上不下。如果會厭囊腫增大，患者還會有吞咽梗阻感，覺得咽東西時不順暢，總有東西擋在咽喉部。此時需與單純慢性咽喉炎進行鑒別，如果服用治療慢性咽喉炎的藥，咽部異物感或者梗阻感不消失，可能要考慮手術治療。嚴重的會厭囊腫，囊腫如果長得比較大，堵在喉嚨里時，患者還會出現呼吸困難伴發急性感染。一旦出現會厭囊腫合并急性感染，會厭囊腫會突然長得很大，像小水球一樣堵在喉嚨口。嚴重時會出現呼吸困難，甚至是窒息。此時需要醫生及時把會厭囊腫夾破，讓膿液或者水性液體排出，并使會厭囊腫體積縮小，緩解喉部梗阻癥狀，此為非常危險的情況。大部分會厭囊腫只會有咽部異物感的癥狀，如果藥物治療無效，則需要進行手術切除去改善咽喉部異物感、有東西堵、吞咽不順暢的癥狀。