會厭囊腫多發生于會厭谷、舌根部的一種潴留性囊腫，一般兒童較為常見。其中較大年齡的兒童多無癥狀，常在喉部檢查時發現。嬰幼兒可表現出呼吸困難。對于微小的囊腫，可暫不做處理，密切觀察即可；較大的囊腫宜手術切除，手術治療是唯一的治療方案。因其復發率較高，術后患者需定期隨訪，避免復發。另需排除內生性的甲狀舌管囊腫，其與會厭囊腫的臨床表現極為相似，且復發率更高。