由于睪丸和附睪都位于陰囊內，因此睪丸根部疼痛大多由于睪丸、附睪和陰囊原發病變所引起。有時身體其他部位病變也會放射到睪丸，引起睪丸根部的疼痛，具體見于以下：1、睪丸根部急性疼痛，通常見于急性睪丸炎、急性附睪炎、急性睪丸扭轉和睪丸外傷等。上述疾病引起的疼痛特點，表現為疼痛劇烈難忍、疼痛范圍較局限，有時會沿著精索向腰部進行放射。如果是附睪炎或者睪丸炎引起的疼痛，還會出現全身癥狀，比如發熱、寒戰、乏力、不適等癥狀；2、睪丸根部慢性疼痛。通常見于精索靜脈曲張、慢性附睪炎、睪丸鞘膜積液以及睪丸腫瘤等疾病。上述疾病引起的疼痛特點，表現為睪丸區域或者睪丸根部的脹痛、隱痛、墜脹、不適等癥狀，手術癥狀在休息后可以緩解或者消失；3、身體其他部位病變放射到睪丸，引起睪丸根部疼痛，常見于輸尿管、腎臟以及前列腺部位病變。比如輸尿管結石或者慢性前列腺炎，有時會放射到睪丸，引起睪丸根部出現疼痛癥狀。