囊腫是否需要手術切除，取決于囊腫長在什么部位，常見部位有子宮和宮頸、外陰和陰道、卵巢等。如果是病理性的卵巢囊腫，則需要手術切除。1、子宮和宮頸：長在子宮上的囊腫比較少見，一般考慮是肌瘤囊性變，也建議切除。如果是長在宮頸上的宮頸納氏腺囊腫，則是正常的結構，許多人有，不建議做手術處理；2、外陰和陰道：外陰和陰道的囊腫一般也建議切除，因為可能會繼續發展、長大，雖然癌變概率很低，但是也有可能；3、卵巢：最值得關注的是卵巢囊腫，因為這個最常見，卵巢囊腫還分為生理性的和病理性的。生理性質的就是卵巢在正常的月經周期時，形成濾泡囊腫、黃體囊腫，會隨著月經而消失，一般都不會長得很大，這些囊腫不需要手術，不需要處理。病理性囊腫需要處理，包括上皮來源的、漿液性的、黏液性的，還有生殖細胞來源的畸胎瘤等。這些囊腫都建議切除，因為有一定的惡變概率，也會侵蝕卵巢越長越大，或者還有扭轉、破裂的風險。此外，還有一種特殊類型的巧克力囊腫，因為也有一定的惡變概率，也建議手術切除。