結核性肛瘺屬于肺外結核的皮膚腔口型結核，大多是繼發性感染，原發性肛周結核性肛瘺非常少見，具有一定傳染性。結核病發病與否，決定于結核桿菌的菌群數目，以及致毒力，更取決于機體抵抗力。如果機體抵抗力比較弱，結核桿菌的數目又比較多，毒性比較大的時候，傳染性相對比較強。其感染途徑大概有以下三種： 1、直接侵犯肛周器官，比如鄰近器官，如子宮、睪丸、前列腺、尿道、陰道等處直接蔓延，或者直接接觸結核桿菌或接觸帶有結核桿菌的痰液、糞便、尿液以及飲食或其它用具受感染而形成； 2、其它部位中潛在的結核桿菌而引發，比如肺結核、淋巴結核，可以通過淋巴系統或血液系統循環達到肛門直腸周圍而引發； 3、消化道傳播，一些帶菌的食物或者痰液經吞咽以后，經消化道到達肛門直腸周圍而誘發。