絨毛膜上皮癌的治療主要是化療，手術和放療很少應用。但化療會有副作用，比如骨髓抑制，即白細胞降低、紅細胞降低、血小板降低；還會有消化道反應，患者可能出現惡心、嘔吐；女性患者特別注重掉頭發，這是化療的副反應之一。 現在也有很多藥物可以進行相應治療，比如進行骨髓抑制，有較好的長效升白細胞藥物，可以很快使骨髓抑制得到緩解。另外也有較強鎮吐藥，療效較好。患者停止化療后，頭發會自動長出，并不是永久性脫發。化療是絨癌治療非常有效的辦法，但會有副反應，出現副反應的患者經過相應治療可以耐受。