龜頭有小水皰，可能有以下幾個原因：1、生殖器皰疹：性接觸疾病里面常見的生殖器皰疹，由于皰疹病毒通過不潔性接觸，造成龜頭部分的疾患，可能在龜頭、包皮甚至冠狀溝的地方，出現小的水皰，水皰周圍可能出現充血。由于小水皰破裂以后，出現局部的淺表潰瘍，要避免不潔性接觸注意，并且做好保護；2、包皮龜頭炎：普通的包皮龜頭炎可能會產生局部的水皰，還有紅腫、分泌物等；3、皮膚濕疹：皮膚濕疹通常表現有水皰。