奧美拉唑長時間服用，可以對人體造成一定危害，主要如下：1、可以引起機體對鈣和鎂等微量元素的代謝異常，所以如果超量服用，可能引起骨質疏松。特別是對于老年人，本身有合并骨質疏松時，可能危害更大；2、可以引起腸道細菌過度繁殖，特別是長時間在醫院接受治療的患者。這類患者長時間不能自主進食，如果長時間服用奧美拉唑，現象可能更為突出；3、長期服用奧美拉唑，可以刺激胃腔里面出現息肉，但通常不會向腫瘤疾病發展。但如果經如果醫生診斷，如反流性血管炎、胃潰瘍病等疾病，在醫生的指導下，按照病程規律服用奧美拉唑。大部分病人在治療期間，服用2-3個月，甚至半年的奧美拉唑，通常對機體并不會產生上述方面危害。所以主要還是遵循醫囑，避免過度對奧美拉唑潛在的傷害產生恐慌。