原發性甲狀腺功能減退癥通常指原發于甲狀腺功能減退，臨床中會有原發和繼發，實際上相對于是問題出在甲狀腺還是處在垂體。因為甲狀腺分泌甲狀腺激素，靠垂體來指揮。如果是垂體出現了問題，導致甲狀腺分泌功能減低，叫做繼發性甲狀腺功能減退，是因為別的腺體出了問題，是受害腺體。 如果是原發性甲狀腺功能減低，就是指本身甲狀腺發生了問題，自己不分泌，這時上游激素，垂體分泌促甲狀腺激素分泌升高，這種是非常常見的甲狀腺功能減退原因。通常甲狀腺功能表現是T3、T4是減低，促甲狀腺激素升高，提示原發于甲狀腺的甲狀腺功能減低。