雙腎囊腫的患者，通常較好治療。雙腎囊腫通常是指雙腎的多發性囊腫，部分情況可能是指多囊腎。囊腫主要由膨大的腎小管憩室構成，腎小管憩室可以不斷生長、膨大。所以疾病初期時，可能無需特殊治療，但是如果病人囊腫逐漸長大，可能需要考慮進行治療。如果單側腎囊腫，如果數量＜3個，大小＜5cm，并且向內生長，早期治療主要是臨床觀察，可以考慮適當時進行治療。如果腎囊腫＞5cm，并且向內生長，可對腎臟產生一定的擠壓作用，造成部分腎臟部分失去正常的功能，另外可能出現尿路結石、腎積水等。所以此時需要治療，通常是外科治療，包括穿刺抽囊液，注射硬化劑，另外可以行腎囊腫去頂減壓術，甚至可以考慮切除囊腫。因為囊腫本身屬于良性病變，所以只要去除囊腫，對人體的影響即可減輕。