雙腎結石、雙腎囊腫、肌酐升高，存在慢性腎功能不全，是否需要治療結石和囊腫，需要結合具體情況判斷，具體如下：1、不需要：如果結石比較小，比如＜5mm，或者1cm左右，并不引起腎臟的梗阻、積水，即結石不是影響腎功能的原因，同時腎囊腫為良性，位置上也沒有引起腎臟的積水，這種情況下，就不需要進行積極治療。因為進行碎石、取石的手術，或者腎囊腫的手術，均有可能進一步地加重腎功能的損害，或者手術本身也會有一定的創傷和風險；2、需要：如果是結石產生腎臟梗阻，造成腎臟的積水，或者囊腫的位置，長在腎盂旁，正好壓迫腎盂，影響尿液排出。這種情況下，腎結石或腎囊腫，都有可能加重腎功能的損害。這時進行腎結石或腎囊腫的手術，有可能會對腎功能的改善有一定的幫助，可以在充分評估的基礎上考慮手術治療。