圓錐角膜的發生原因目前還不清楚，比較公認的學說就是遺傳學說。圓錐角膜有遺傳傾向存在，有些在家族里父輩有圓錐角膜，孩子圓錐角膜的概率會比較高。另外就是角膜當中有一種酶比較活躍，酶可以使得角膜的膠原纖維得到溶解，如果纖維得到溶解之后，角膜壁就會軟化，慢慢變薄，變薄之后在正常眼內壓的作用下，就會發生局部的前凸。 圓錐角膜就是角膜從本來球形的狀態，變成中間好像小山丘一樣的凸起，影響到屈光矯正的質量，會造成視覺的嚴重下降。還有一些危險因素，比如有的人在圓錐角膜發生之前頻繁揉眼，因為有過敏性的結膜炎，頻繁的揉眼誘發了圓錐角膜的發生，還有通宵的熬夜，打電子游戲，眼睛可能在免疫力下降的情況下，發生圓錐角膜。還與先天的眼疾患有關，比如唐氏綜合征等。