腹腔結核的治療方法跟常規結核病類似，主要是規律抗結核治療。出現相應的癥狀時，比如有腹腔積液的情況下，可以積極的穿刺抽腹腔積液，腸結核的情況下要保持大便通暢。在飲食方面也要注意進食容易消化、吸收的食物，有助于疾病的恢復，同時也減少出現不全性腸梗阻的幾率，減少并發癥的發生。 腹腔結核最基本的原則是積極進行抗結核治療，不僅藥物要足量而且時間也要較為規律。因為腹腔結核會影響腹腔中其它器官，比如肝臟，多數腹腔結核病人同時合并有肝結核、腎結核等鄰近器官的結核疾病，所以容易出現肝腎功能異常，在治療上要注意相關并發癥的出現。