甲溝炎發作期，尤其是感染、滲出較明顯時，患者可以口服頭孢類抗生素，頭孢類藥物具有一定的抗感染作用。但治療甲溝炎，除口服抗生素外，患者還需要其它治療方法進行輔助治療。甲溝炎主要是細菌感染，感染可以在局部形成積聚又難以引流，形成局部的感染病灶，并反復存在、復發。因此患者在急性發作期，尤其是炎癥的紅、腫、熱、痛、流水期，可以使用抗生素，包括使用頭孢類藥物進行治療。頭孢類藥物在抗感染方面，具有比較廣泛的敏感性和殺菌力。頭孢類藥物雖然對控制炎癥有較好的幫助作用，但是仍然有其局限性，因此甲溝炎的治療不能完全依賴于藥物。甲溝的獨特性是炎癥不容易引流而容易復發，因此需進行甲溝的局部消毒，以及傷口引流，同時避免指甲受壓并保持局部干燥。上述方法綜合運用可以更好處理甲溝炎，對癥處理的同時，能夠盡量避免甲溝炎的復發。