扁桃體結石有時積聚過多，在吞咽動作如咳嗽，或惡心、嘔吐等情況下，可能會自行脫落。對于成年人，這種脫落通常沒有風險，但部分患者可能會結石脫落后墜入氣道，引發氣管異物，通常多見于老年人或幼兒，由于喉、氣道功能尚不完善或退化而出現上述情況，建議前往當地醫院耳鼻喉科門診就診，明確診斷是否為氣管異物，必要時行氣管異物取出術。大部分扁桃體結石，通常不會自行脫落，較小的結石有時可以沒有任何癥狀，若患者出現明顯咽內異物感或口臭，可以考慮用鑷子或吸引器將結石取出。而較大結石有時可能會阻塞扁桃體引流，引發局部炎癥、疼痛或全身發熱等不適，此時要前往當地醫院耳鼻喉科門診就診，有時取出困難，可能需要在局部浸潤麻醉下切開排石。