甲溝炎分為急性甲溝炎和慢性甲溝炎，急性甲溝炎發病時間比較短，出現化膿、紅、腫、熱、痛，這是感染的表現，通常是細菌性，所以用抗細菌的藥膏，如夫西地酸乳膏、復方多粘菌素B軟膏或莫匹羅星軟膏，對甲溝炎有抗細菌作用。還有一種慢性甲溝炎，其為一種局部由真菌、念珠菌定植引起的疾病，另外由刺激物導致。 慢性甲溝炎時間較長，這時用抗細菌的藥膏效果不佳，以上幾個藥膏效果都不佳，這時要到醫院來檢查判斷是否為真菌性甲溝炎，若是需加抗真菌藥物，如果是慢性刺激性的甲溝炎，要加激素類藥物，用復方制劑來治療。嚴重時甲溝炎可以口服藥物，尤其急性甲溝炎嚴重時可以吃抗生素，再嚴重時還可以拔指甲引流，再配合外用和口服藥物治療。