耳垂后根部疼痛，首先需考慮有無炎癥的可能，此處有可能會因鰓裂瘺管感染而造成疼痛，可檢查耳垂根部有無瘺管口或腫脹。如果有瘺管和隆起或有腫脹、結節，考慮為鰓裂瘺管。患者需進行增強核磁共振，查看瘺管大小和范圍。如果確診有鰓裂瘺管，可手術切除。鰓裂瘺管最重要的是需要排除和面神經的聯系，如果鰓裂瘺管范圍過大，接觸到面神經，手術難度會較大。因為多數鰓裂瘺管會處于腮腺內，核磁共振的目的是排除鰓裂瘺管和腮腺及面神經的關系。如果其解剖結構關系較清楚，手術會變得簡單，也不會發生面癱等嚴重并發癥。此外，耳朵后面疼痛，少數情況下也有中耳炎的可能性，需尋求醫生查看耳朵內有無炎癥。