耳垂根部疼痛的常見原因包括外耳道炎癥、外耳道腫瘤、偏頭痛等。當發現耳垂根部疼痛時，建議患者到醫院檢查外耳道是否有炎癥、腫塊等，另外也要檢查鼓膜的情況。如果發現外耳道炎，可以口服抗生素治療。如果發現外耳道腫塊或者彌漫性腫脹，應考慮腫瘤的可能性，患者可以先做病理活檢。如果確認是腫瘤，應按照腫瘤的情況進行手術。如果是良性腫瘤，只需局部切除，如果是惡性腫瘤，應將整個外耳道以及鼓膜連同周圍的腮腺一起切除。如果不是腫瘤，則可能是偏頭痛所致。如果耳朵沒有任何外表炎癥，排除中耳、外耳以及顱內的病變以后，發生疼痛且反復發作，則可考慮偏頭痛。如果確認是偏頭痛，應按照偏頭痛的藥物治療。