心臟肥大通常可以恢復，心臟肥大的程度不同，恢復的程度和所需時間也不同，比如心臟的肥大是因為心肌損傷或心肌炎導致，而且僅僅是輕度的心臟肥大，經過積極的對因治療或營養心肌的治療，肥大的心肌可能在短時間之內完全恢復到正常。還有部分心臟肥大程度比較嚴重的患者，同時病程也比較長，恢復所需時間相對更長。部分人可以完全恢復到正常，但也有部分心肌肥大可能只能部分恢復到正常，所以心肌肥大的預后與肥大的程度和病程呈正相關。此外還要分析心肌肥大的病因，若是某些繼發性的原因導致了心臟肥大，比如高血壓導致的左心室的肥厚伴勞損，隨著血壓得到有效的控制，心臟肥大可以在短時間之內恢復至正常。但如果心臟肥大是因為心肌的病變，比如是肥厚型心肌病，是因為編碼心肌的基因出現改變，導致心肌細胞的形態和功能出現異常，此種心臟的肥大可能恢復欠佳，甚至無法恢復。