經常扁桃體發炎，會引起扁桃體長期、慢性炎癥，使扁桃體腫大明顯，患者會有咽腔阻塞感。如果扁桃體腫大到一定程度，會引起咽腔狹窄，導致患者打鼾，尤其是有些患者會引起打鼾過程當中出現呼吸暫停，即睡眠呼吸暫停綜合征。同時可以伴有缺氧癥狀，如白天嗜睡以及精神萎靡不振。還有些患者較亢奮，引起精神煩躁，引起心率變化以及冠心病，還有些患者引起腦梗、腦出血一系列變化。慢性扁桃體炎會影響到咽喉，引起咽喉炎癥，導致咽干、咳嗽以及異物感等癥狀，向上可以侵襲咽鼓管，導致患者出現耳悶、耳鳴、聽力下降。較嚴重的慢性扁桃體炎的患者會導致遠期并發癥，如出現風濕性關節炎、風濕性心臟病或腎炎等情況。