睡醒后頭疼原因原因較多，具體如下：一、原發性頭疼：如偏頭疼、緊張性頭疼、沖擊性頭疼，睡醒后可能出現頭疼；二、繼發性頭疼：繼發性頭疼原因較多，1、全身系統性疾病，如發燒或感冒，晨峰血壓可引起頭痛，煤氣中毒睡醒后也會出現頭疼。2、顱內外器質性疾病可以引起醒后頭痛，比如鼻竇炎、青光眼、牙周炎以及牙髓炎都可以引起頭面部疼痛。顱內器質性疾病，如腦炎、腦膜炎，腫瘤、腦血管病、腦出血以及血栓形成或頭部外傷導致硬膜下血腫等，都可以出現頭疼。