沙眼衣原體引起沙眼的癥狀，包括早期和中晚期。早期的感染引起畏光、流淚、異物感、眼睛紅腫等表現，如果病情進一步發展，可以累及角膜、眼瞼的瞼板，出現角膜血管翳或瞼板變形，出現內翻、倒睫。角膜血管翳更進一步加重，出現畏光、流淚，甚至出現角膜混濁、視力下降、視物模糊等。瞼板腺的改變引起眼瞼位置的變化，出現眼瞼內翻、倒睫。內翻、倒睫又加重眼睛不適，出現角膜的損傷加重，流淚、異物感更加明顯。沙眼的流行病學經過解放后衛生條件的極大改善，經濟的巨大進步，目前沙眼在我國的患病率已經非常少，而且癥狀也比較輕微。一般容易把結膜炎與沙眼混為一談，真正的由沙眼衣原體引起的沙眼比較少見。