Ⅱ型呼吸衰竭的血氣診斷標準是氧分壓＜60mmHg，二氧化碳分壓＞50mmHg，即體內氧氣減少、二氧化碳潴留。Ⅱ型呼吸衰竭最常見的疾病，包括慢性阻塞性肺疾病、支氣管哮喘、肺結核等。發生Ⅱ型呼吸衰竭，一般可以給予無創正壓通氣或有創機械通氣等方式，幫助提高氧分壓、降低二氧化碳。如果存在氣道痙攣，可以考慮靜脈使用糖皮激素，如注射用甲潑尼龍琥珀酸鈉。同時給予霧化吸入短效β-受體激動劑，如沙丁胺醇，并聯合吸入短效的抗膽堿能藥，如異丙托溴銨，也可同時靜脈使用茶堿類藥物，如氨茶堿、多索茶堿，通過這些治療，可以緩解氣道痙攣，從而促進二氧化碳的排出。Ⅱ型呼吸衰竭嚴重時會出現肺性腦病，主要見于二氧化碳大量潴留，引起了神志改變。輕者會出現神志淡漠、胡言亂語的癥狀，重者會發生昏迷等嚴重意識障礙。