腦頂疼痛常見病因如下：1、腦內疾病：腦部腫瘤，如膠質瘤、淋巴瘤、轉移瘤、腦膜癌病以及肺癌、肝癌等腦部的轉移瘤等都可以出現腦頂部的疼痛。病人通常伴發惡心、嘔吐等顱高壓表現；2、腦內的血管病：如蛛網膜下腔出血、腦出血患者，通常可以出現頭痛、惡心、嘔吐等癥狀，腦出血如果影響到肢體的運動，還可以出現偏癱、偏身感覺障礙等；3、腦部炎癥：顱內感染，比如病毒性腦炎、結核性腦炎等也可以出現腦頂部的疼痛；4、內科系統疾病：高血壓，原發性頭痛，如偏頭痛，叢集性頭痛以及緊張性頭痛也可以出現腦頂部疼痛。