頭孢氨芐和頭孢克肟同屬于頭孢菌素類的抗菌藥物，但兩種藥品有一些區別，具體如下：1、分代不同：頭孢氨芐屬于第一代頭孢菌素，主要是對革蘭氏陽性菌具有較明顯的抗菌作用。頭孢克肟是屬于第三代的頭孢菌素，頭孢克肟是廣譜的抗菌素，對革蘭氏陽性菌、革蘭氏陰性菌具有明顯的抗菌作用；2、作用不同：頭孢氨芐在臨床上主要是用于輕、中度的感染性疾病，比如比較適合用于上呼吸道的感染，可以用于皮膚和軟組織的感染，可以用于敏感菌所導致的泌尿系統的感染。頭孢克肟具有廣譜的抗菌作用，因此應用的范圍較廣，可以用于呼吸系統感染，既包括上呼吸道的感染，也包括下呼吸道的感染。另外該藥物也適合用于胃腸道的感染，泌尿、生殖系統的感染以及其他部位的感染性疾病。