干擾素是針對乙肝病毒復制抗病毒治療中，比較有效的抗病毒藥物，但并不是所有大三陽患者都適合干擾素治療。在選擇合適的患者應用干擾素的時候，能獲得比較好的效果，使病毒的復制指標轉陰，甚至能使表面抗原轉移，所以大三陽打干擾素有成功轉陽的可能。干擾素一般應用于提高病毒的轉移率的時候，只適用于患者轉氨酶高的情況，通常轉氨酶需要在80-400U/L，轉氨酶高說明體內有肝臟有炎癥損傷，但是也不能太嚴重。另外，病毒量比較低，表面抗原水平比較低的患者，即3000IU/ml以下的情況下，說明體內的病毒含量比較低，而且需要膽紅素正常的情況下，應用干擾素才能得到比較好的效果，使HBV-DNA降到正常水平以下，而且會出現e抗原的轉換，即大三陽轉成小三陽。甚至有的患者會出現表面抗原的轉換，就是表面抗原轉陰，表面抗體出現，此時停止應用干擾素以后，病毒不容易反彈，而且肝功能穩定，這種狀態就是發生乙肝病毒的臨床治愈，為最好的治療效果。干擾素抗乙肝病毒，主要發揮的除了直接抗病毒作用以外，能刺激機體的免疫系統，發揮抗病毒的作用，得到持久的免疫控制。停用干擾素以后，病毒不容易反彈，而且干擾素含有抗纖維化，能夠起到預防肝癌的作用。