月經期間，應根據病情需要決定是否進行艾灸。如果只是把艾灸作為調理月經手段，建議在月經結束之后到下次月經來潮之前，進行艾灸治療，可有效調理月經情況。月經期間進行艾灸需要一定的適應癥，比如虛寒性痛經，艾灸的治療效果非常好。更有些病人，稱為崩漏，西醫又稱功能性子宮出血，月經量特別大，或者來月經的時候淋漓不凈，沒有時間進行完結。這個時候建議艾灸治療，而其它時間盡量不干預月經，使其自然完成。在月經期間進行的艾灸治療，如痛經時，通常習慣性艾灸腹部以及腰骶部位，在治療崩漏的時候，經常艾灸隱白穴，可以有效治療崩漏。