小肚子和腰痛的原因主要如下：1、盆腔炎：已婚已育的女性尤其易患慢性盆腔炎，炎性沿著盆腔兩側蔓延、遷延，可造成小肚子和腰痛，此時應就診于婦科，但男性發生盆腔炎的概率較小；2、月經期：有一定的子宮充血、子宮內膜脫落，可造成盆腔的應激反應，出現小肚子和腰痛，通常需進行保暖、休息等；3、盆腔占位性病變：如盆腔腫瘤、骶前腫瘤或盆腔腹膜后腫瘤，侵犯脊髓神經根時也會造成小肚子和腰痛，此時應行腹部CT檢查，并做相應治療，必要時需進行手術治療；4、自主神經功能紊亂：通常在排除器質性疾病后可考慮自主神經功能紊亂導致的小肚子和腰痛，應針對性給予藥物治療，通常有一定作用。