深蹲腰疼的原因有很多，如腰椎間盤突出、腰肌勞損等，具體如下：1、腰椎間盤突出：深蹲腰疼最常見的原因，是腰椎的椎間盤突出，在深蹲以后脊通常前彎曲，此時就會壓迫椎間盤，椎間盤向后突出，突出了以后就壓迫后面的硬膜囊或者神經根，造成腰部疼痛，特別是往前彎得特別厲害時，腰疼更容易發生；2、腰肌勞損：因為腰部的肌肉本身就拉傷了，深蹲蹲下來時，一般腰是往前傾，往前傾時腰背肌就繃緊了，也會產生腰痛；3、其他：比較少見，比如腰椎結核或者腫瘤。但是在深蹲時，腰因為彎得比較厲害，有可能刺激腰椎，此時會因為有炎癥刺激，會刺激腰部肌肉產生疼痛癥狀，此時要到醫院做腰椎的磁共振，或者必要的檢查，來輔助明確具體原因。