核磁共振檢查無電離輻射，對人體不會造成輻射損傷，但檢查時間相對較長，存在一定噪聲，檢查過程中射頻脈沖會產生熱效應，少數患者有可能會出現胸悶、心慌、心悸等不適癥狀，但比例較少。磁共振檢查，例如頭顱、頸椎、腰椎等部位，患者處于相對狹小空間，幽閉恐懼癥患者可能會出現焦慮、心跳加快等反應。 MR檢查前醫生會向患者簡單介紹檢查步驟，告訴患者可能會出現的癥狀，消除緊張、恐懼心理，使患者精神放松。告知患者掃描時會產生噪聲，讓患者閉眼，不必理會噪聲，必要時會讓親屬陪在患者身旁，讓親屬握住患者的手增加患者的安全感。告知患者檢查大約所需要時間，讓患者做好充分的心理準備。 MR檢查全過程要求受檢部位靜止不動，幼兒躁動以及身體不適的老年患者可能無法配合完成檢查，會根據患者自身情況選擇合適掃描參數，盡量減少掃描時間，必要時會聯系臨床醫生給予鎮靜藥物后再進行檢查。