先天性腦囊腫指蛛網膜囊腫，在兒童發病率比較高，但大多數蛛網膜囊腫屬于先天性因素導致，未產生癥狀，所以大多數蛛網膜囊腫無需處理。如果蛛網膜囊腫較大，產生一定的壓迫癥狀，引起中線結構的偏移，需要進行手術解除蛛網膜囊腫的壓迫現象。如果兒童顱內蛛網膜囊腫超過4cm，即使沒有引起癥狀，不需要手術。但建議這類兒童平時避免劇烈活動，尤其是參加球類項目，盡量不要損傷頭部。否則可能會導致顱內的蛛網膜囊腫破裂，產生嚴重的頭痛，甚至需要手術。