腦干腦炎能活多久，不能一概而論，腦干腦炎是臨床上一種相對少見的疾病，主要原因是診斷困難。對于腦干腦炎，只要診斷明確，給予及時的免疫治療，大部分的患者預后都可以。對于這種患者，大概不到一半的患者磁共振上能夠看到病變，可能更多的患者磁共振是正常的表現。但是患者有部分特殊的臨床表現，比如會出現眼球活動的障礙，四肢活動的不協調，即共濟失調，甚至會有意識障礙的出現，一般出現意識障礙的患者，代表病情比較重，可能預后不良。如果一個腦干腦炎患者診斷明確，但是能夠給予特殊的治療措施，比如營養支持、免疫治療，可能對患者的壽命沒有太大影響，患者經過特殊的治療之后，病情逐漸地減輕，也可能會遺留部分后遺癥，但是生命基本不受影響。相對而言，如果患者磁共振，在腦內發現了異常，并且有意識障礙，再加上治療不及時，以及患者的基礎病比較多，其預后通常比較差。也可能部分患者在住院的過程中就出現了生命的危險。