目前多數脊索瘤通過顱底內鏡手術進行治療，即通過鼻腔插入，到達患者顱底，通過內鏡深入到達鞍區結構、斜坡區域或者頸內動脈旁中顱窩底，進行內鏡的擴大手術切除，進行手術干預。通過充分利用內鏡優勢、底鏡照明，可以精細地觀察到脊索瘤侵犯的結構和頸內動脈之間的關系，避開海綿竇和重要神經進行手術治療。 顱底內鏡手術為現代神經外科治療的主流，也是通過手術技術的演變，給患者相對微創又相對安全的治療方式。過去開顱手術治療到達斜坡需要艱苦的開顱過程，對患者造成較的創傷或者風險也較大。現在擴大經鼻的內鏡手術完全可以達到同樣治療效果，且對患者損傷較小。