脊柱裂手術后遺癥的情況，需要根據患者的病情來定。脊柱裂手術通常在神經外科的顯微鏡操作下進行，并且術中常會有電生理監測來保駕護航。總體上手術比較安全，不容易出現后遺癥。特別是對于單純脊髓栓系、單純終絲增粗的患者，手術后通常神經癥狀都能夠明顯緩解，也不容易出現后遺癥。對于比較嚴重的脊膜膨出、脊髓脊膜膨出、脂肪瘤型的脊髓栓系患者，在手術之后有可能患者原有的神經功能障礙會加重。因為長時間的病變，使神經受到一定程度的影響，神經可能已經發生變性。雖然在手術過程中，把病變進行了妥善的處理，但是神經對于這種輕微的騷擾仍然難以耐受，手術之后有可能出現下肢運動、感覺功能障礙、以及大小便功能障礙的加重，從而遺留下肢運動功能障礙，排便、排尿功能障礙，嚴重時還可能會出現大小便失禁的情況。還有部分患者會由于局部皮膚、傷口愈合不良，而造成腦脊液漏，造成感染和一些圍手術期的并發癥。