手足口病是由腸道病毒感染引起，腸道病毒有很多種，如EV71、柯薩奇、埃可等病毒，以上病毒感染都會導致手足口病。 手足口病發病后出現發熱，其持續的時間跟不同的病毒也有關系，如EV71病毒會比較嚴重，出現嚴重的情況，其發熱時間會較長，柯薩奇、埃可等病毒出現重癥的可能性較小，其發熱時間會較短。 一般情況下普通的手足口病患兒2-3天基本上發熱就能結束，但是如果出現嚴重的情況，如出現腦膜炎、腦炎、其他部位的損害表現時，發熱的時間會延長，延長的時間跟腦炎或腦膜炎的損傷程度、持續時間有密切關系，具體時間會較長，約1-2周的時間。