腸道感染吃的藥主要是抗感染的藥物，具體是哪種藥物主要看感染的病原體。具體如下：1、細菌性感染：細菌性感染比較多，急性腸炎、急性胃腸炎可能和大腸桿菌之類的細菌性感染有關，可能是吃廣譜的抗生素，比如左氧氟沙星、諾氟沙星，這些都是很常用的治療急性腸炎、腸道感染的藥物。腸道感染還包括結核桿菌感染，腸結核需要吃抗結核桿菌的藥物，規范抗結核治療；2、病毒性感染：針對病毒性感染，沒有特效藥物，此種情況用對癥的止瀉藥即可。對于病毒性感染或細菌性感染都是通用的，都可以用蒙脫石散類的止瀉藥物，還有益生菌去進行治療。腸道感染不需要也不建議長期使用抗生素，因為長期使用抗生素，在殺滅有害細菌的同時，也會殺滅相對正常的細菌，對腸道菌群有破壞作用。所以長期使用抗生素反而會影響腸道菌群，對身體健康造成負面的影響，需要注意，所以不要長期、大量、過度地使用抗生素。