顱骨修補手術一般手術時間是2-3個小時，包括手術麻醉時間、手術時間以及術后麻醉蘇醒時間，可能需要3-4個小時。手術過程一般為進入手術室后對患者進行全身麻醉，觀察生命體征平穩，沿原來切口進行消毒，進行手術鋪單后沿原來手術切口打開，暴露缺損部位，分離皮瓣和腦組織后徹底暴露缺損部位。 而對于不同手術部位存在不同的手術時間，例如常見額顳缺損部位，由于分離顳肌和腦組織，手術時間相對較長。對于凸面顱骨缺損修補手術，因其不涉及顳肌及腦組織分離，手術時間相對較短，所以顱骨缺損修復手術時間因部位不同有所差異。