耳朵根部一陣一陣的疼，可能是外耳道有耵聹、急性中耳炎、外耳道內有異物、化膿性中耳炎、神經疼等原因引起，具體如下：1、外耳道有耵聹：如果外耳道的耵聹比較多并且比較硬，刺激外耳道壁會出現耳朵疼痛；2、急性中耳炎：急性中耳炎是由于細菌、病毒侵犯到上呼吸道，出現耳膜充血、出現炎癥，會出現耳朵一陣一陣的疼；3、外耳道內有異物：當有蟲子或者有其他的小東西進到耳朵里面，在耳道里面來回滾動時撞擊到耳道以及耳膜，也會出現耳朵一陣一陣的疼；4、化膿性中耳炎：當出現化膿性中耳炎時，中耳腔內的分泌物、膿液流到外耳道，刺激到耳道也會出現疼痛；5、神經疼：耳朵本身沒有問題，但是由于耳部周圍的神經出現病變，也可以出現耳朵疼痛。