室間隔增厚主要在臨床上見于高血壓以及肥厚型心肌病，而這種室間隔的增厚最主要的危害，即可以使得室壁的厚度增加，進而導致心室壁變得僵硬，主要直接影響到心臟舒張功能。其舒張功能主要是影響到血液回流時，心臟擴張的程度較差，而出現一些左室舒張末壓力的增高，表現出左心功能不全。這種情況，患者可以在活動量增加時出現胸悶、氣短這樣的一些表現。由于高血壓引起的室間隔肥厚，上述癥狀最為明顯。而如果要是由于肥厚型心肌病引起的室間隔異常肥厚，不對稱肥厚帶來左室流出道的梗阻，這種室間隔增厚就會由于過度肥厚，而使得心臟在收縮時引起左室流出道變窄，而出現流出道梗阻，就會出現相應的勞力性呼吸困難、勞力性胸痛，以及勞力性頭暈、黑蒙等這樣的臨床表現。所以室間隔肥厚的危害主要取決于引起異常的原因，一般高血壓肥厚嚴重時，可能會影響到左心功能。而由于非對稱性的肥厚型心肌病引起的室間隔肥厚，會帶來左室流出道的梗阻，而出現勞力性胸痛、呼吸困難，以及頭暈、黑蒙。