通常短期應用制菌霉素，對于嬰兒沒有什么副作用。制菌霉素是一種抗真菌感染的抗菌素，臨床上多用于治療嬰兒的鵝口瘡。當嬰兒有鵝口瘡，即念珠菌感染時，可以應用制霉菌素涂抹于口腔，由于抗真菌作用非常好，所以通常2-3天鵝口瘡能夠得到非常有效的控制。因此制菌霉素對于嬰兒來說，短時間的應用基本上沒有明顯的副作用，是非常安全的藥物。但是如果長期、大量地使用制菌霉素，可能會對嬰兒造成一些副作用，主要有以下幾個方面：1、出現胃腸道的反應，比如惡心、嘔吐、食欲的下降等；2、造成腸道菌群的紊亂。