制霉素陰道栓主要可以用于陰道真菌感染性疾病，副作用主要表現在陰道給藥部位的局部反應，比如有些患者用藥后可能會出現過敏反應，包括用藥部位瘙癢、紅腫、刺痛或者不適的感覺。如果出現比較嚴重的相關的癥狀，建議及時停止使用，并且最好能夠告知醫生或者藥師。另外在使用制霉素陰道栓時需要注意個人衛生，在給藥時需要佩戴手套或者指套，將栓劑放入陰道的深處。在藥物治療期間最好能夠避免性生活，或者在進行性生活時佩戴避孕套，防止交叉感染。如果患者使用一個療程后，癥狀仍然沒有明顯改善，建議及時到醫院就診。