顱咽管瘤是良性腫瘤，如果可以手術完整切除，可以治愈。由于顱咽管瘤的特殊性，決定顱咽管瘤不能輕易地說可以治好。顱咽管瘤是來源于胚胎期間退化的結構，稱為顱咽管。顱咽管是連接顱腦和咽部的一根管，像神經管一樣。咽鼓管在胚胎發育期間較為重要，但隨著胚胎年齡的逐漸增加，隨著孩子后期的出生，此結構會逐漸萎縮。但有可能會殘留部分顱咽管細胞在原始部位，在成年以后，或者是在出生以后，會發育成顱咽管。顱咽管瘤的位置較差，位于腦的中心結構，通常位于垂體柄。由于其周圍都是重要的結構，比如三腦室、視交叉、兩側的頸總動脈，前方是視神經。做手術通常只能從這些結構當中的縫隙里進去，如果損傷其中任何一個重要的結構，都是災難性的結果。上述原因導致進行顱咽管手術的時候，很難將其切除，就意味著有可能會有少量的腫瘤組織殘留，有殘留會有復發的可能。但是對于經驗豐富，或者腫瘤較小的患者，盡早手術有機會使顱咽管瘤達到根治的效果。