膽囊結石最常見的并發癥是因膽囊管堵塞造成膽囊排空障礙，膽囊因內部高壓造成膽囊感染，感染導致膽囊出現劇烈痙攣性、陣發性疼痛，膽囊壓力增高以后還會造成膽囊內出現細菌感染，如化膿性感染可以引起患者發生高熱，還可以引起膽囊壁壞死及穿孔，造成膽汁性腹膜炎。部分穿孔被包裹以后造成局部性腹腔膿腫。 較小結石可通過膽囊管排到膽總管以后引起膽源性胰腺炎，但大部分輕癥胰腺炎都為一過性，進行緊急治療后可以恢復。但部分胰腺炎屬于重癥胰腺炎，可以危及生命。