肝癌的腫瘤標志物包括甲胎蛋白、CA19-9、癌胚抗原等，不同來源的腫瘤標志物存在較大差別，需進行選擇，具體如下：1、肝臟來源：可分為原發性肝癌和轉移性肝癌，原發性肝癌指腫瘤細胞來自于肝臟本身，包括肝細胞肝癌和肝內膽管癌，肝細胞肝癌的腫瘤標志物主要指甲胎蛋白水平，而肝內膽管癌腫瘤標志物異常升高的是CA19-9；2、結直腸來源：發生肝轉移引起的肝癌，腫瘤標志物主要是CEA即癌胚抗原；3、其他來源：胰腺來源的腫瘤主要是以CA19-9為主，卵巢來源的腫瘤可能會出現CA12-5的異常升高，而胃癌肝轉移會出現CA72-4的異常升高，以及肺癌、乳腺癌、甲狀腺癌等，這些惡性腫瘤分別有自己的腫瘤標志物。