雙側上頜竇囊腫的治療方法，要根據囊腫大小、臨床癥狀輕重進行選擇。大多數雙側上頜竇囊腫，都是無意間進行其它檢查時發現，如拍片、做CT時。較小的囊腫如果沒有明確的癥狀和不適，不需要進行特殊治療，但需定期拍片進行復查，關注發展和變化。雙側上頜竇囊腫如果沒有發展、不引起癥狀，患者可以長期共存。上頜竇囊腫如果有進一步發展，會造成上頜竇分泌口堵塞，引起類似上頜竇發炎的癥狀，常見的有鼻塞、鼻涕分泌物增多、流膿，甚至會出現頭發悶或頭痛癥狀。雙側上頜竇囊腫需積極尋求手術治療，目前隨著治療技術的發展，可以通過內鏡手術方式進行，即不做手術切口，通過上頜竇的天然開口將內鏡伸入，對囊腫進行刮治。當完整刮除上頜竇黏膜和下方囊腫后，病變疾病去除，癥狀即可緩解。但患者術后仍然要注意對局部的保護，減少感冒和鼻竇炎癥的反復發作，否則雙側的上頜竇囊腫，有一定的復發概率和可能性。