內鏡下黏膜剝離術手術的并發癥，最重要的要考慮兩條：一個是出血，第二個是穿孔。 出血和穿孔，既可以在手術當中出來，也可以在手術之后，被稱為遲發性出血和穿孔，遲發性出血可以在1個小時之后到手術之后的14天。遲發性出血和穿孔的整個發生比例，早年時可以高達10%。 隨著技術充分掌握以后，已經變的越來越安全，現在整個發生率大概3%左右，相對是比較安全的。