椎動脈夾層治療主要通過介入進行治療，在栓塞瘤腔的基礎上，通過在椎動脈放置支架或密網支架，可以有效改變局部血流動力學，修復和重建血管使夾層閉塞。非優勢側椎動脈出現夾層，可以直接行血管孤立術，在夾層段填塞彈簧圈將夾層和載瘤動脈閉塞，但若患者無嚴重癥狀不建議使用。顱內段椎動脈夾層，甚至形成夾層動脈瘤，動脈瘤較大會引起腦干壓迫癥狀，此時可以進行椎動脈孤立手術，即將椎動脈完全閉塞。 優勢椎動脈孤立會引起腦干缺血，需要進行血管搭橋手術。由于椎動脈夾層特殊的病理特點，一般很難完全自愈。對于程度輕微的椎動脈夾層，夾層真腔血流壓力可能逐漸變大，甚至完全終止假腔血流，夾層可以自愈，但概率較小。部分夾層通過藥物治療可以得到改善，主要是抗凝藥物，如華法林等，大部分夾層需要通過介入治療才能完全恢復血流，從而使夾層閉塞。