癌胚抗原是臨床上多種惡性腫瘤的腫瘤標志物，例如胃癌、乳腺惡性腫瘤、胰腺惡性腫瘤、腸道惡性腫瘤、食管惡性腫瘤、原發性肺臟惡性腫瘤等疾病，都可能會出現癌胚抗原這項指標的升高。臨床上一般不單純檢測這項指標，還需要結合其他的腫瘤指標，來綜合地進行癌癥病變的早期篩查，例如糖類抗原系列的檢查、甲胎蛋白、前列腺癌抗原、鱗狀細胞癌抗原等多種腫瘤標志物檢查，與癌胚抗原檢查一起作為輔助診斷癌癥的一項重要腫瘤指標。除了這些惡性腫瘤疾病可能會出現癌胚抗原增高外，還有一些非腫瘤疾病，同樣可能會導致癌胚抗原指標異常。因此，臨床上出現這項指標異常時，應該進一步完善檢查，評估是哪種惡性腫瘤導致，或者是其他非腫瘤疾病導致，才能有效地采取治療措施。